11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2580 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  96.08 
 
 		 51 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  86.27 
 
 		 51 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  82.98 
 
 		 59 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  63.27 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2649  hypothetical protein  57.14 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  normal  0.0307301 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  55.1 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  53.7 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  58.54 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1178  hypothetical protein  75 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  58.82 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>