26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1860 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1860  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0995872  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05851  hypothetical protein  97.97 
 
 
295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.450432  normal  0.960414 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05321  hypothetical protein  57.75 
 
 
295 aa  351  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.440556  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07741  hypothetical protein  55.37 
 
 
299 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.311592 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1638  hypothetical protein  52.82 
 
 
293 aa  308  8e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05851  hypothetical protein  49.3 
 
 
301 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05931  hypothetical protein  51.04 
 
 
301 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05551  hypothetical protein  49.82 
 
 
301 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0529  hypothetical protein  48.96 
 
 
301 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.784322  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0725  hypothetical protein  50.89 
 
 
294 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4383  protein of unknown function DUF1092  39.12 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4445  protein of unknown function DUF1092  39.12 
 
 
293 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.414391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2159  hypothetical protein  37.93 
 
 
286 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0060  protein of unknown function DUF1092  38.83 
 
 
290 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1936  hypothetical protein  36.55 
 
 
286 aa  188  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1590  hypothetical protein  36.97 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.846445  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0781  protein of unknown function DUF1092  35.31 
 
 
288 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4728  hypothetical protein  36.21 
 
 
286 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88180  psaB translation factor  33.56 
 
 
379 aa  149  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363654  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3687  hypothetical protein  30.51 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0136  hypothetical protein  29.35 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000036691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1387  protein of unknown function DUF1092  28.72 
 
 
271 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535562 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11792  predicted protein  28.92 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.733277  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4636  hypothetical protein  29.02 
 
 
265 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.190902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4118  protein of unknown function DUF1092  25.68 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4079  protein of unknown function DUF1092  25.68 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>