15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_20287 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_20287  predicted protein  100 
 
 
311 aa  624  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000000360095  normal  0.0368137 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08117  fatty acid elongase (Gns1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02760)  57.06 
 
 
340 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0234777 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34675  Fatty acyl-CoA elongase/Polyunsaturated fatty acid specific elongation enzyme  60.42 
 
 
336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.653716  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06435  conserved hypothetical protein  52.67 
 
 
299 aa  288  7e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00110  fatty acid elongase, putative  55.65 
 
 
297 aa  249  5e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424466  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33532  predicted protein  30.73 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150608 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16376  predicted protein  32.55 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.982896  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20508  elongase delta 6 elongase  29.18 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0418317  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49867  predicted protein  31.6 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668859  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22274  delta 6 desaturase  32.28 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000806412  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9255  predicted protein  25.68 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0895405  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00981  fatty acid elongase (Gig30), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16710)  32.46 
 
 
534 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80894  normal  0.789612 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80911  predicted protein  25.53 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176886  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48622  predicted protein  33.9 
 
 
287 aa  56.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00534035  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34485  long chain acyl-coa elongase  26.85 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>