12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4568 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4568    100 
 
 
453 bp  898    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.623994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  83.86 
 
 
1200 bp  178  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  82.12 
 
 
1218 bp  155  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  82.12 
 
 
1218 bp  155  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  81.5 
 
 
1191 bp  131  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  80.93 
 
 
1161 bp  121  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0038    91.11 
 
 
867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  82.32 
 
 
1155 bp  105  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  79.5 
 
 
1185 bp  71.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  79.5 
 
 
1185 bp  71.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  83.95 
 
 
1209 bp  58  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  82.14 
 
 
1386 bp  48.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>