35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00310  putative peptidyl-prolyl isomerase  100 
 
 
428 aa  841  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0028  putative lipoprotein  86.68 
 
 
428 aa  696  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.43 
 
 
300 aa  61.6  3e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.61276e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1752  foldase protein PrsA  24.54 
 
 
271 aa  59.7  9e-08  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.21 
 
 
324 aa  57.4  5e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.67752e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0643  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.12 
 
 
276 aa  56.2  1e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0729  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.42 
 
 
314 aa  55.8  1e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.53 
 
 
336 aa  55.5  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54337e-14 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0957  peptidylprolyl isomerase  31.82 
 
 
289 aa  55.5  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4226  peptidylprolyl isomerase  31.53 
 
 
289 aa  54.7  3e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0107977  hitchhiker  0.00167093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1207  peptidylprolyl isomerase  33.33 
 
 
287 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  26.55 
 
 
313 aa  52.8  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0952  peptidylprolyl isomerase  32.99 
 
 
287 aa  52.4  1e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1145  peptidylprolyl isomerase  31.25 
 
 
287 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1087  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  30.83 
 
 
618 aa  52.4  2e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0366769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.27 
 
 
355 aa  52.4  2e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.72 
 
 
323 aa  51.2  3e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.37747e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0887  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.57 
 
 
249 aa  50.4  5e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0142655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1077  peptidylprolyl isomerase  31.19 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.07 
 
 
305 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.2571e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0809  peptidylprolyl isomerase  26.67 
 
 
282 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0974  peptidylprolyl isomerase  30.58 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1041  peptidylprolyl isomerase  30.58 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0962  peptidylprolyl isomerase  30.58 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 
301 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0583  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.12 
 
 
667 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  5.01806e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1119  peptidylprolyl isomerase  30.58 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.211203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  26.32 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.56 
 
 
310 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.69336e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.83 
 
 
281 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1730  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.68 
 
 
289 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0385  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.41 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2806  peptidylprolyl isomerase  23.27 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0253  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  23.53 
 
 
248 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1221  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.36 
 
 
308 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>