31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2349 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 104 aa  206  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  55 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  73.33 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  73.33 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  73.33 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  50.75 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  53.7 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  53.7 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  56.25 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  36.21 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  40 
 
 		 97 aa  48.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  44.19 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  40.68 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  48.78 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  37.74 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  33.9 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  37.5 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  55.81 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  30 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  37.21 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  41.86 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  51.22 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  36.96 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  35.71 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  38.98 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  32.84 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  38.1 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  38.1 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  38.1 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>