17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0141 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0141  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  348  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194352  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0225  hypothetical protein  46.75 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2721  hypothetical protein  49.66 
 
 
151 aa  140  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0284  hypothetical protein  45.7 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2935  hypothetical protein  49.3 
 
 
161 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2118  hypothetical protein  45.86 
 
 
329 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0581  hypothetical protein  43.79 
 
 
152 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0128888  normal  0.544391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0627  hypothetical protein  43.71 
 
 
151 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.682126  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2067  hypothetical protein  46.2 
 
 
155 aa  124  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2404  hypothetical protein  47.1 
 
 
151 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1575  hypothetical protein  47.71 
 
 
164 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0155  hypothetical protein  44.67 
 
 
163 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.155827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3596  hypothetical protein  40.76 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2162  hypothetical protein  43.42 
 
 
154 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.592508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0598  hypothetical protein  46.05 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0392  hypothetical protein  40.27 
 
 
159 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  28.37 
 
 
437 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>