48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0081 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  329  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  37.32 
 
 
151 aa  103  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  40.44 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  31.97 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  37.06 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  30.19 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  35.07 
 
 
142 aa  94.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  33.76 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  32.17 
 
 
146 aa  90.9  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  34.13 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  33.11 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  30.82 
 
 
144 aa  87.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  30.67 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  34.09 
 
 
173 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  35.46 
 
 
165 aa  84.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  32.8 
 
 
183 aa  84  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  32.37 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  32.84 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  35.88 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  30.41 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  30.94 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  36.64 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  30.71 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  32.33 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  30.83 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  34.33 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  32.37 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  30.83 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  29.45 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  32.37 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  29.45 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  28 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  36.28 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  31.15 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  30.23 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  28.95 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  28.26 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  31.71 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  28.57 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  26.38 
 
 
170 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  26.21 
 
 
159 aa  54.7  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  26.52 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  32.04 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  23.28 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0648  flagellar assembly protein FliW  31.4 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486344  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1093  flagellar assembly protein FliW  31.4 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1218  flagellar assembly protein FliW  31.4 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.462259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>