223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2132 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  87.83 
 
 
424 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
420 aa  825    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  98.33 
 
 
420 aa  811    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  61.56 
 
 
416 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6794  glycosyl transferase family 28  61.03 
 
 
412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2036  glycosyl transferase family protein  56.26 
 
 
452 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4922  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
435 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  37.72 
 
 
426 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  37.22 
 
 
426 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  34.56 
 
 
439 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.56 
 
 
439 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1457  glycosyl transferase family 28  30.56 
 
 
415 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.21 
 
 
475 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.21 
 
 
475 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0558  glycosyl transferase family protein  35.49 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2480  glycosyl transferase family 28  30.52 
 
 
416 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5187  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00893984  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  32.41 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1905  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1906  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
403 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1800  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2048  glycosyl transferase family 28  31.52 
 
 
425 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0362  sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.72 
 
 
417 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0442187  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93762  predicted protein  31.51 
 
 
434 aa  121  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0057  glycosyl transferase family 28  27.19 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3732  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.303192  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3714  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.6 
 
 
422 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0168  sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.93 
 
 
427 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.398755  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  26.56 
 
 
426 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4524  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
421 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0485  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
451 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.716398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0073  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
419 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3605  sterol 3-beta-glucosyltransferase  31.32 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0177  sterol 3-beta-glucosyltransferase  27.63 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2387  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2034  hypothetical protein  25.87 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.906883  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0009  glycosyl transferase family 28  26.05 
 
 
423 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.463057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3043  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.3 
 
 
419 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372483 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10600  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase  26.27 
 
 
425 aa  94  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4758  glycosyl transferase family 28  26.98 
 
 
418 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3800  sterol 3-beta-glucosyltransferase  30.56 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.306929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4844  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.59 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2083  sterol 3-beta-glucosyltransferase  25.58 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5942  glycosyl transferase family 28  29.53 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547483  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11559  glycosyltransferase  27.52 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5461  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0907  sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.6 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.499452  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2894  sterol 3-beta-glucosyltransferase  27.63 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4841  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.98 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3101  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61797  normal  0.564364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4642  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3721  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0718  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.04 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194717  normal  0.0259108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0690  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.04 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5006  sterol 3-beta-glucosyltransferase  29 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.794532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3452  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8827  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.57 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11557  glycosyltransferase  27.52 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3770  sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.1 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_1174  predicted protein  25.98 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5724  Glycosyl transferase  27.83 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1037  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  34.81 
 
 
462 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2291  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.21 
 
 
415 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0972144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1806  macrolide glycosyltransferase  22.7 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2593  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1350  glycosyl transferase family 28  26.97 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0373  sterol 3-beta-glucosyltransferase  26.19 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2111  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 
425 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000775281  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  26.95 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2696  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  29.08 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3115  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
421 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3175  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
421 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.62 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5179  glycosyl transferase  30.27 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  20.42 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00487  sterol glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04880)  23.39 
 
 
749 aa  70.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  28.7 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  19.44 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2852  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_191  Sterol 3-beta-glucosyltransferase (Autophagy-related protein 26) (UDP-glycosyltransferase 51)  21.65 
 
 
1249 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1915  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  25.06 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4408  glycosyltransferase, MGT family  30.7 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3114  Glycosyl transferase-like UDP- glucuronosyltransferase  30.24 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.826951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>