14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1319 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  100 
 
 		 67 aa  140  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  35.82 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  35.82 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  32.84 
 
 		 159 aa  48.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  33.82 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  28.12 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  36.84 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  26.47 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  29.63 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>