53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  65.22 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  60.53 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  60.91 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  58.04 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  57.76 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  58.04 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  62.62 
 
 		 115 aa  133  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  56.14 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  57.27 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  57.27 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  58.33 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  52.21 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  58.42 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  58.76 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  56.12 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  55.56 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  55.14 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  52.88 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  54.39 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  54.17 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2167  electron transport protein  58.23 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  39.64 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  38.14 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  38.21 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  35.14 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  35.78 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  37.78 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  36.79 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  34.91 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  35.96 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  32.41 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  32.41 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  35.19 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  34.07 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  34.82 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  30.91 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  31.07 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  35.34 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  30.56 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  33.64 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  34.44 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  34.23 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  34.44 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  32.73 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  34.44 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>