61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1892 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  61.74 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  59.29 
 
 		 116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  62.16 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  63.55 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  60.87 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  63.16 
 
 		 114 aa  134  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  56.88 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  58.88 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  54.78 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  54.78 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  53.45 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  58.7 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  60.19 
 
 		 117 aa  120  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  52.59 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  59.81 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  52.59 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  54.95 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  55.05 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  55.05 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  52.29 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  55.05 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  53.33 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  54.17 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  52.38 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  55.95 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  51.38 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  53.26 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  52.17 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  52.78 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  48.35 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  47.25 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  47.25 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  47.25 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  47.25 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  45.24 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  44.76 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  39.64 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  34.69 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  36.94 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  35.71 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  37.36 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  39.42 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  33.93 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  35.85 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  37.86 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  40.66 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  36.89 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  36.11 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  34.62 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  34.62 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  34.86 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  36.17 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  37.89 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  36.78 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  33.64 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  34.75 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  32.26 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  32.17 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>