14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0098 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0098  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
349 aa  671    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1752  peptidase A24A prepilin type IV  60.39 
 
 
352 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1780  Peptidase A24B, FlaK domain protein  54.44 
 
 
375 aa  326  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2136  peptidase A24A prepilin type IV  46.43 
 
 
330 aa  282  7.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0855  Peptidase A24B, FlaK domain protein  47.2 
 
 
334 aa  255  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1491  hypothetical protein  27.13 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0062  peptidase A24B, FlaK-like  28.57 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2921  hypothetical protein  26.29 
 
 
276 aa  63.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2005  peptidase A24A, prepilin type IV  28.27 
 
 
268 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.234873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0687  peptidase A24A prepilin type IV  28.96 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.890474  normal  0.372888 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0269  peptidase A24B, FlaK-like protein  25.55 
 
 
234 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.205091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0122  hypothetical protein  25.71 
 
 
255 aa  52.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0184  peptidase A24B, FlaK-like protein  28.89 
 
 
234 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.932953  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1915  peptidase A24A, prepilin type IV  27.37 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.764763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>