15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1390 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1390  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  241  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000105557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2891  nitrate reductase, alpha subunit  35.71 
 
 
1254 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1706  nitrate reductase 2, alpha subunit  34.57 
 
 
1246 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01426  nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit  34.57 
 
 
1246 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2179  nitrate reductase, alpha subunit  34.57 
 
 
1246 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.615849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0299  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  38.46 
 
 
1254 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242426  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0275  nitrate reductase, alpha subunit  38.46 
 
 
1254 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1552  nitrate reductase, alpha subunit  34.57 
 
 
1246 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1649  nitrate reductase, alpha subunit  34.57 
 
 
1256 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2188  nitrate reductase, alpha subunit  34.57 
 
 
1246 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2078  nitrate reductase 2, alpha subunit  34.57 
 
 
1246 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01438  hypothetical protein  34.57 
 
 
1246 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2236  nitrate reductase, alpha subunit  36.07 
 
 
1247 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.829152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1853  nitrate reductase, alpha subunit  34.92 
 
 
1257 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2883  nitrate reductase, alpha subunit  37.5 
 
 
1240 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.912631  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>