24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0057 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0057  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0055  hypothetical protein  97.2 
 
 		 214 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000944015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3458  hypothetical protein  74.47 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0197  hypothetical protein  65.31 
 
 		 212 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3698  hypothetical protein  58.41 
 
 		 211 aa  248  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3151  hypothetical protein  56.34 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1284  hypothetical protein  45.3 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.103295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3235  hypothetical protein  43.3 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4150  hypothetical protein  47.5 
 
 		 236 aa  141  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4149  hypothetical protein  43.82 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2973  hypothetical protein  42.23 
 
 		 196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3544  hypothetical protein  44.95 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0480  hypothetical protein  47.24 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.58191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0475  hypothetical protein  47.24 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0447  hypothetical protein  47.88 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3987  hypothetical protein  42.21 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3440  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3678  hypothetical protein  35.79 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1177  hypothetical protein  37.2 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1160  hypothetical protein  37.2 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1187  hypothetical protein  37.2 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326391  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1621  hypothetical protein  36.57 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1837  hypothetical protein  41.83 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1500  hypothetical protein  35.22 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624694  normal  0.50616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>