24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0055 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0055  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44015e-12 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0057  hypothetical protein  97.2 
 
 
214 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3458  hypothetical protein  69.09 
 
 
220 aa  280  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0197  hypothetical protein  65.82 
 
 
212 aa  257  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3698  hypothetical protein  58.41 
 
 
211 aa  248  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3151  hypothetical protein  57.21 
 
 
217 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1284  hypothetical protein  43.39 
 
 
193 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.103295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3235  hypothetical protein  42.19 
 
 
193 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4150  hypothetical protein  46.88 
 
 
236 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4149  hypothetical protein  44.38 
 
 
208 aa  140  2e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2973  hypothetical protein  42.23 
 
 
196 aa  138  8e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3544  hypothetical protein  45.45 
 
 
219 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.107447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0475  hypothetical protein  47.85 
 
 
241 aa  135  6e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0480  hypothetical protein  47.85 
 
 
241 aa  135  7e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.58191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0447  hypothetical protein  47.88 
 
 
236 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3987  hypothetical protein  41.83 
 
 
158 aa  117  1e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3440  hypothetical protein  40.38 
 
 
202 aa  113  2e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3678  hypothetical protein  35.79 
 
 
222 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1160  hypothetical protein  37.74 
 
 
203 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1177  hypothetical protein  37.74 
 
 
203 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1187  hypothetical protein  37.74 
 
 
203 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326391  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1621  hypothetical protein  36.57 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1837  hypothetical protein  41.94 
 
 
187 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1500  hypothetical protein  35.33 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624694  normal  0.50616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>