21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0039 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0039  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2907  hypothetical protein  75.76 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1981  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.510264  normal  0.259293 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4340  hypothetical protein  50.47 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2201  hypothetical protein  50.47 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911557  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06650  hypothetical protein  46.73 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2642  XRE family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2599  hypothetical protein  41.41 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2643  hypothetical protein  41.41 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0926652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4582  hypothetical protein  46 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.804527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0385  hypothetical protein  67.8 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5551  hypothetical protein  29.89 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.074617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0475  hypothetical protein  41.79 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5942  hypothetical protein  41.79 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0581  hypothetical protein  41.79 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3446  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.256834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4726  hypothetical protein  31.65 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4275  hypothetical protein  30.12 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4217  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2541  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2736  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>