More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4437 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4437  para-aminobenzoate synthase component II  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0638297  normal  0.334939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0133  para-aminobenzoate synthase component II  81.48 
 
 
216 aa  360  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0018  anthranilate synthase, component II  71.5 
 
 
220 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0034  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  71.43 
 
 
223 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0054  para-aminobenzoate synthase component II  66.2 
 
 
216 aa  278  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0049  para-aminobenzoate synthase component II  65.74 
 
 
216 aa  274  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0075  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  65.73 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00350  anthranilate synthase, component II  68.06 
 
 
213 aa  271  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.144238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0014  para-aminobenzoate synthase component II  62.5 
 
 
224 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.275677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0014  para-aminobenzoate synthase component II  62.5 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0022  para-aminobenzoate synthase component II  62.5 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0193701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0020  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  68.06 
 
 
213 aa  267  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0026  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  69.43 
 
 
213 aa  266  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0813  para-aminobenzoate synthase component II  62.88 
 
 
234 aa  266  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.15052  normal  0.770082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10013  para-aminobenzoate synthase component II  65.69 
 
 
232 aa  261  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0024  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  65.09 
 
 
216 aa  261  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0022  para-aminobenzoate synthase component II  64.25 
 
 
224 aa  261  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0039  para-aminobenzoate synthase component II  64.32 
 
 
211 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0017  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.9 
 
 
222 aa  247  9e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0024  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.93 
 
 
207 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00170  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or aminodeoxychorismate synthase  60.68 
 
 
211 aa  238  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0025  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.62 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0019  anthranilate synthase, component II  56.22 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0056  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.95 
 
 
196 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454168  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0110  anthranilate synthase component II  60.75 
 
 
190 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0168  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.33 
 
 
211 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.663863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27000  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or aminodeoxychorismate synthase  57.35 
 
 
229 aa  225  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0019  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.77 
 
 
213 aa  222  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000622445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  50.25 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00740  anthranilate synthase, component II  57.21 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0062  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.2 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  50.52 
 
 
195 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  56.76 
 
 
204 aa  217  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.26 
 
 
195 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.26 
 
 
195 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  48.77 
 
 
195 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.75 
 
 
195 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  52.97 
 
 
195 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.75 
 
 
195 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.75 
 
 
195 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  49.75 
 
 
195 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  48.28 
 
 
195 aa  214  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.59 
 
 
197 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3227  anthranilate synthase, component II  55.56 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2136  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.05 
 
 
196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.198158  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3099  anthranilate synthase component II  54.84 
 
 
193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.757854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.43 
 
 
188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  53.23 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.46 
 
 
200 aa  211  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  53.48 
 
 
197 aa  211  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.69 
 
 
192 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  54.79 
 
 
192 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1880  anthranilate synthase, component II  50.27 
 
 
195 aa  211  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573908  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0712  anthranilate synthase component II  52.94 
 
 
195 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.089943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2002  anthranilate synthase component II  52.94 
 
 
195 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.387565  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0176  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.53 
 
 
188 aa  209  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0597  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.85 
 
 
199 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  52.43 
 
 
188 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  55.14 
 
 
195 aa  208  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  52.97 
 
 
189 aa  208  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  51.6 
 
 
190 aa  208  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  52.15 
 
 
189 aa  208  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0368  anthranilate synthase component II  51.6 
 
 
190 aa  207  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1254  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.61 
 
 
198 aa  207  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0157  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.68 
 
 
198 aa  207  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02131  para-aminobenzoate synthase component II  50.52 
 
 
198 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4125  anthranilate synthase, component II  54.5 
 
 
191 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2048  anthranilate synthase component II  52.69 
 
 
187 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0195497  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4053  anthranilate synthase, component II  53.03 
 
 
204 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  50.26 
 
 
190 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.81 
 
 
188 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0460  anthranilate synthase component II  50.78 
 
 
200 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2776  anthranilate synthase component II  51.61 
 
 
198 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000091878  hitchhiker  0.00000280107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0907  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  51.08 
 
 
201 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000149415  hitchhiker  0.00000000332325 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.73 
 
 
197 aa  205  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2096  anthranilate synthase, component II  55.79 
 
 
188 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.53 
 
 
204 aa  204  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.21 
 
 
191 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1211  anthranilate synthase component II  51.32 
 
 
190 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.903358  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3497  anthranilate synthase component II  50.26 
 
 
200 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.317495  hitchhiker  0.000454644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2861  anthranilate synthase component II  51.34 
 
 
195 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0438  anthranilate synthase component II  51.87 
 
 
199 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0462  anthranilate synthase component II  51.87 
 
 
199 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1868  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.77 
 
 
195 aa  202  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0505  anthranilate synthase component II  51.87 
 
 
199 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.624854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2572  anthranilate synthase component II  51.87 
 
 
199 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  54.59 
 
 
187 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0533  anthranilate synthase component II  51.87 
 
 
199 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3652  anthranilate synthase component II  50.78 
 
 
194 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.05 
 
 
190 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  51.08 
 
 
189 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  54.05 
 
 
187 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  54.05 
 
 
190 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0101  anthranilate synthase component II  50.26 
 
 
201 aa  202  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.134219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  51.61 
 
 
189 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  54.05 
 
 
187 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0784  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.26 
 
 
546 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.919428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3620  anthranilate synthase component II  50.81 
 
 
196 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
544 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.87 
 
 
193 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>