9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1326 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01157    97.81 
 
 		 901 bp  1649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000150145  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2466  Hemolysin E family protein  99.12 
 
 		 912 bp  1737    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1283    97.59 
 
 		 1046 bp  1637    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000752669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1326    100 
 
 		 911 bp  1806    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000620502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2443    97.81 
 
 		 901 bp  1649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000764973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1967  hemolysin E  98.9 
 
 		 912 bp  1721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000212688  normal  0.94466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1678  hemolysin E  86.73 
 
 		 912 bp  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491556  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1668  hemolysin E  98.46 
 
 		 1056 bp  1689    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01167    97.81 
 
 		 901 bp  1649    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000631021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>