15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3535 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3535  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00377319  hitchhiker  0.000000298784 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2608  tRNA-Arg  94.94 
 
 		 79 bp  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2263  tRNA-Arg  93.67 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.545845  hitchhiker  0.00000000419015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2795  tRNA-Arg  93.67 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3217  tRNA-Arg  93.67 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421297  hitchhiker  0.0091644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2908  tRNA-Arg  92.41 
 
 		 79 bp  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000133712  hitchhiker  0.0000000000417601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1602  tRNA-OTHER  91.14 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1341  tRNA-OTHER  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00273807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2344  tRNA-OTHER  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00900097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1166  tRNA-Arg  89.87 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0069  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4646  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5012  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0083  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0358  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.714214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>