10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_10003 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  100 
 
 		 3075 bp  872    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10003    100 
 
 		 450 bp  892    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000367207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  100 
 
 		 3075 bp  872    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  99.32 
 
 		 3075 bp  848    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  100 
 
 		 3075 bp  872    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  99.77 
 
 		 3075 bp  864    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  97.25 
 
 		 3075 bp  771    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  96.59 
 
 		 3075 bp  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  100 
 
 		 3075 bp  872    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  84.17 
 
 		 3087 bp  87.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>