33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2297 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2297  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  338  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1082  hypothetical protein  38.18 
 
 
206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00041216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0543  hypothetical protein  39.62 
 
 
200 aa  130  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326293  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2213  hypothetical protein  36.71 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0092  hypothetical protein  36.71 
 
 
196 aa  124  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1511  hypothetical protein  36.81 
 
 
199 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2434  hypothetical protein  38.71 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2001  hypothetical protein  35.22 
 
 
200 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1967  hypothetical protein  35.22 
 
 
200 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.213308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0566  hypothetical protein  39.62 
 
 
182 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000599705  normal  0.489552 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1533  Protein of unknown function DUF2179  41.18 
 
 
195 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00263143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1448  hypothetical protein  35.4 
 
 
208 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.399753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3389  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3420  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3170  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3154  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00210271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3064  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1367  hypothetical protein  36.31 
 
 
179 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3394  hypothetical protein  34.38 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3368  hypothetical protein  34.38 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3390  hypothetical protein  34.38 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365729  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0791  hypothetical protein  35 
 
 
222 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2502  hypothetical protein  37.66 
 
 
169 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000489476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1857  hypothetical protein  33.75 
 
 
182 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3093  hypothetical protein  34.38 
 
 
183 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0081056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2136  hypothetical protein  34.38 
 
 
181 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3052  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  104  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0605  hypothetical protein  35.22 
 
 
190 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.872406 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1901  hypothetical protein  33.95 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2514  hypothetical protein  30.63 
 
 
184 aa  90.9  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.719359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0526  hypothetical protein  34.38 
 
 
168 aa  87  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2065  hypothetical protein  27.15 
 
 
223 aa  84.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111401  hitchhiker  0.00131952 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1797  hypothetical protein  25.17 
 
 
175 aa  58.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.106722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>