32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1367 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1367  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  361  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0566  hypothetical protein  76.83 
 
 
182 aa  264  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000599705  normal  0.489552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0092  hypothetical protein  40.59 
 
 
196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0543  hypothetical protein  37.63 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326293  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1082  hypothetical protein  40.74 
 
 
206 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00041216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2434  hypothetical protein  37.36 
 
 
195 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2213  hypothetical protein  37.34 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1511  hypothetical protein  40.25 
 
 
199 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2502  hypothetical protein  37.66 
 
 
169 aa  111  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000489476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1533  Protein of unknown function DUF2179  37.65 
 
 
195 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00263143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0791  hypothetical protein  35.85 
 
 
222 aa  104  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2297  hypothetical protein  36.31 
 
 
171 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0605  hypothetical protein  31.58 
 
 
190 aa  98.2  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.872406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2514  hypothetical protein  33.92 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.719359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1901  hypothetical protein  35.29 
 
 
202 aa  93.6  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0526  hypothetical protein  36.11 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2001  hypothetical protein  28.03 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1448  hypothetical protein  28.03 
 
 
208 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.399753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1967  hypothetical protein  28.03 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.213308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3052  hypothetical protein  31.29 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2065  hypothetical protein  30.88 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111401  hitchhiker  0.00131952 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3420  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3064  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3394  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3368  hypothetical protein  28.49 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3154  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00210271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3389  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3170  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3390  hypothetical protein  28.49 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1857  hypothetical protein  28.49 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3093  hypothetical protein  29.87 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0081056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2136  hypothetical protein  28.09 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>