11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0374 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0374  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000778981  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0372  hypothetical protein  93.07 
 
 
466 aa  535  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000191651  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0398  hypothetical protein  93.07 
 
 
466 aa  535  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000077648  normal  0.524896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0954  hypothetical protein  91.61 
 
 
466 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  hitchhiker  0.0000000572086 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2521  hypothetical protein  95.32 
 
 
371 aa  345  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2518  hypothetical protein  93.4 
 
 
115 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.871393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1074  hypothetical protein  23.85 
 
 
514 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2978  hypothetical protein  23.85 
 
 
514 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  hitchhiker  0.00212324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4374  hypothetical protein  23.85 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200864  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2232  hypothetical protein  29.93 
 
 
476 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00123188  unclonable  0.00000000989665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0921  hypothetical protein  29.93 
 
 
476 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>