38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5721 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5721  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277173  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3695  hypothetical protein  73.13 
 
 
212 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.841303  normal  0.591313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0498  hypothetical protein  72.69 
 
 
212 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2546  hypothetical protein  76.79 
 
 
177 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3573  hypothetical protein  75 
 
 
196 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0597766  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3947  hypothetical protein  75 
 
 
196 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180618  normal  0.604818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5109  hypothetical protein  74.11 
 
 
194 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3488  hypothetical protein  75.89 
 
 
196 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00401228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0057  hypothetical protein  75 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1825  hypothetical protein  56.65 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00129958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2133  hypothetical protein  69.64 
 
 
192 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5307  hypothetical protein  75 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1751  hypothetical protein  70.54 
 
 
194 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235962  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1321  hypothetical protein  69.64 
 
 
259 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3678  hypothetical protein  69.64 
 
 
188 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1304  hypothetical protein  67.86 
 
 
241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0044  hypothetical protein  68.75 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1544  hypothetical protein  68.75 
 
 
191 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210916  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1456  hypothetical protein  68.75 
 
 
191 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5539  hypothetical protein  66.07 
 
 
194 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642633  normal  0.0183709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3014  hypothetical protein  52.87 
 
 
320 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3738  hypothetical protein  65.18 
 
 
199 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0989  hypothetical protein  54.46 
 
 
139 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1231  hypothetical protein  51.25 
 
 
199 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0559905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003557  hypothetical protein  48.44 
 
 
210 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000457432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02518  hypothetical protein  47.66 
 
 
210 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3132  hypothetical protein  58.04 
 
 
271 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3233  hypothetical protein  58.04 
 
 
271 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2053  hypothetical protein  38.96 
 
 
202 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0738137  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3034  hypothetical protein  58.04 
 
 
200 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0344  hypothetical protein  49.21 
 
 
178 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2808  hypothetical protein  35.71 
 
 
186 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0150  hypothetical protein  46.9 
 
 
238 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01560  tubulin binding protein, putative  67.35 
 
 
2072 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492475  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  44.71 
 
 
491 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1702  articulin, putative  50.88 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2125  hypothetical protein  54.05 
 
 
200 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  62.5 
 
 
2664 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>