14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4702 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4702  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58970  hypothetical protein  37.79 
 
 		 235 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160858  normal  0.0216719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4442  hypothetical protein  34.11 
 
 		 210 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1153  hypothetical protein  34.56 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0687  hypothetical protein  33.57 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3967  hypothetical protein  30.66 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0782123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3682  hypothetical protein  36.03 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1724  hypothetical protein  34.62 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3946  hypothetical protein  28.8 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3383  hypothetical protein  44.74 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15820  hypothetical protein  32.65 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0630612  hitchhiker  0.0000678597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0880  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 178 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0299  HNH endonuclease  48.65 
 
 		 162 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0049  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>