18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0882 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0882  excisionase family DNA-binding protein  100 
 
 		 74 aa  150  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000814624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0025  DNA binding domain protein, excisionase family  51.85 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.917253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0344  DNA binding domain protein, excisionase family  50.98 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1745  DNA binding domain protein, excisionase family  43.4 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3699  hypothetical protein  38 
 
 		 55 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3698  DNA binding domain protein, excisionase family  43.14 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  42.86 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000791415  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3593  hypothetical protein  41.07 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  40.82 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2632  hypothetical protein  46.81 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2142  excisionase/Xis, DNA-binding  44.68 
 
 		 80 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.276898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3435  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 75 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  35.29 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1985  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000030807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4168  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1579  DNA binding domain protein, excisionase family  42.37 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.963252  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0288  excisionase, putative  38.46 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>