23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1656 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1656  ChaB family protein  100 
 
 
69 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4919  ChaB  60 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0756604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  49.06 
 
 
68 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3951  ChaB family protein  40.74 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385591  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0930  ChaB family protein  45 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2429  ChaB family protein  39.39 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01205  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1325  cation transport regulator  39.39 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2406  cation transport regulator  39.39 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000158278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1923  cation transport regulator  39.39 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.41011  normal  0.0497517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01195  cation transport regulator  39.39 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1700  cation transport regulator  39.39 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.692804  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1384  cation transport regulator  39.39 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.886338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1367  cation transport regulator  39.39 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0817532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1965  cation transport regulator  40.32 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.640932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1907  cation transport regulator  40.32 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1369  cation transport regulator  40.32 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.760537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1553  cation transport regulator  40.32 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.203336 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1901  cation transport regulator  40.32 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.252452 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0020  ChaB family protein  41.27 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  41.86 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3607  ChaB  37.5 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0044472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1848  ChaB family protein  39.68 
 
 
76 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>