20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5298 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5298  protein of unknown function DUF98  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0556574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3957  hypothetical protein  31.9 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0701  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 		 515 aa  75.9  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.187582  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1624  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  35.44 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.931737  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0935  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  30.95 
 
 		 509 aa  65.1  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0128  hypothetical protein  29.87 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1697  hypothetical protein  32.94 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1562  hypothetical protein  34.71 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.911918  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0349  hypothetical protein  33.14 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0595803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12963  hypothetical protein  27.33 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1064  hypothetical protein  34.71 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.618696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3390  hypothetical protein  26.92 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.00000000204141 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1262  hypothetical protein  26.97 
 
 		 173 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1054  hypothetical protein  29.87 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1148  GHMP kinase group 1  30.3 
 
 		 519 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3289  hypothetical protein  28 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.677915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1568  protein of unknown function DUF564  29.11 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232035  hitchhiker  0.00190267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0050  hypothetical protein  28.48 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0515  hypothetical protein  27.88 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0375  protein of unknown function DUF564  28.22 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>