77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0097 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0097  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
139 aa  283  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.530776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2052  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.29 
 
 
138 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.842309  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.6 
 
 
143 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.392689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3728  glyoxalase family protein  44.6 
 
 
142 aa  130  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4296  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.43 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5362  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.88 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.76 
 
 
145 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1945  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.07 
 
 
150 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869019  hitchhiker  0.00300875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1252  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.88 
 
 
142 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.61 
 
 
140 aa  122  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3047  lactoylglutathione lyase  42.03 
 
 
146 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1165  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.69 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0390  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.1 
 
 
145 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2038  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.76 
 
 
143 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58620  hypothetical protein  43.28 
 
 
141 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2653  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 
133 aa  116  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.78 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2342  hypothetical protein  42.45 
 
 
149 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.96 
 
 
144 aa  114  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.697141  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4393  glyoxalase/bleomycin resistance protein dioxygenase superfamily protein  45.39 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1215  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.49 
 
 
140 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.743705  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.54 
 
 
140 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.53 
 
 
140 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.07 
 
 
140 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1345  hypothetical protein  43.07 
 
 
140 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3083  glyoxalase family protein  40.88 
 
 
144 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.01 
 
 
144 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.13 
 
 
140 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.54 
 
 
143 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.243786  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.41 
 
 
139 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.728322  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.56 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4513  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6100  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.96 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.57 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1207  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.88 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.381304 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.55 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.57 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5393  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.06 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324521  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.81 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4416  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.31 
 
 
140 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1814  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.17 
 
 
141 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.071852  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.2 
 
 
211 aa  92  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.39 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0279674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2048  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.04 
 
 
140 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2050  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0859008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3394  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.88 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3522  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5132  hypothetical protein  34.4 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0779  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.47 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4197  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1750  hypothetical protein  35.48 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634592  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3214  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.07 
 
 
277 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000855792  normal  0.159914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2211  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
265 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6284  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511658  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143948  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1878  lactoylglutathione lyase  39.08 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2493  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000450738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
138 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587684  normal  0.324112 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2185  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8843  hypothetical protein  36.07 
 
 
215 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.158291 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  30.4 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0168  glyoxalase family protein  30.15 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2818  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79772  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0174  glyoxalase family protein  30.15 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5249  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.24 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000066738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1263  hypothetical protein  26.61 
 
 
137 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.616957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7115  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.41 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599769  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2762  hypothetical protein  43.48 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>