16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0026 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0026  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0018  hypothetical protein  76.92 
 
 		 109 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.313448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0046  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  65.62 
 
 		 105 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0028  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  77.63 
 
 		 101 aa  129  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0842094  normal  0.917965 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0045  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.36 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0047  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  72.15 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2017  hypothetical protein  61.64 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.870487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.33 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.16 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2055  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.1 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.12 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.19 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.1 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.12 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>