20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7337 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7337  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  253  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0971863  hitchhiker  0.000142423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3518  hypothetical protein  46.49 
 
 
132 aa  104  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3893  hypothetical protein  43.48 
 
 
137 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5307  hypothetical protein  47.46 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393038  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4628  hypothetical protein  45.54 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0203811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1380  hypothetical protein  42.11 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1599  hypothetical protein  43.09 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233492  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1159  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417033  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1545  protein of unknown function DUF477  38.05 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11860  protein of unknown function (DUF477)  36.07 
 
 
171 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7328  hypothetical protein  43.1 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723791  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1141  hypothetical protein  40.87 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1827  hypothetical protein  37.61 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000185967  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1395  hypothetical protein  30.33 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00858881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3612  hypothetical protein  33.73 
 
 
161 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3680  hypothetical protein  33.73 
 
 
161 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3607  hypothetical protein  33.73 
 
 
161 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4061  hypothetical protein  32.53 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2575  hypothetical protein  32.53 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12493  hypothetical protein  27.66 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.226542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>