More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2833 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  1.02319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2828  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000743233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.63239e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.36278e-07  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.59101e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.55238e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.55238e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.27545e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.35495e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.45614e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.31941e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.6104e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.33655e-07  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.37608e-07  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.37124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  3.64712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.20417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.09558e-07  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.18875e-05  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.55678e-05  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  97.1 
 
 
76 bp  121  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.2419e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  97.1 
 
 
76 bp  121  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  97.1 
 
 
76 bp  121  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.28006e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  97.1 
 
 
76 bp  121  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.90046e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  97.1 
 
 
76 bp  121  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0092  tRNA-Glu  97.1 
 
 
76 bp  121  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.05241e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  97.1 
 
 
76 bp  121  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.25295e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  95.83 
 
 
76 bp  119  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  95.83 
 
 
76 bp  119  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  95.83 
 
 
76 bp  119  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  95.83 
 
 
76 bp  119  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  1.93498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0098  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000377978  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0101  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.1614e-06  normal  0.113768 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0102  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.00176e-06  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.16599e-06  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0099  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000375203  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t048  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.95727e-06  normal  0.0121931 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0097  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121483  normal  0.112474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0096  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00116613  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0043  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.64581e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0044  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.61143e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.52021e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.03782e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0047  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.19759e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t049  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.28796e-05  normal  0.0118369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0095  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00314986  normal  0.201708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0084  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000274947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t047  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.7485e-06  normal  0.0120138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0083  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00174717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0085  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.05777e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.2653e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.67651e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.82107e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t041  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.2755e-08  normal  0.0206852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t043  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.1621e-08  normal  0.0207862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0072  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.0686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0076  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.1411e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t046  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.26543e-07  normal  0.0218713 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t045  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.08863e-08  normal  0.0209012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.60023e-08  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.84885e-10  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0100  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0345698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  8.52764e-08  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  8.29998e-05  normal  0.652684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>