21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00540 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA00540  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  313  7e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.288962  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_50872  histone H3 isoform 1b  69.63 
 
 
136 aa  176  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11841  histone H3 isoform 1a  69.63 
 
 
136 aa  176  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50695  histone H3 isoform 1c  69.63 
 
 
136 aa  176  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17380  predicted protein  68.15 
 
 
136 aa  174  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00249476 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38934  predicted protein  68.15 
 
 
136 aa  174  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0906859 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32891  predicted protein  65.93 
 
 
136 aa  172  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06554  hypothetical protein similar to histone H3 (Broad)  59.33 
 
 
191 aa  171  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21239  H3.3  65.19 
 
 
136 aa  169  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00733  Histone H3 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P23753]  65.93 
 
 
136 aa  169  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013922  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00570  histone H3, putative  64.96 
 
 
138 aa  169  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17026  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69601  predicted protein  65.19 
 
 
136 aa  168  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0806469  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90527  predicted protein  64.44 
 
 
136 aa  167  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73330  predicted protein  64.44 
 
 
136 aa  167  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136215  normal  0.357299 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02540  DNA binding protein, putative  64.96 
 
 
138 aa  166  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54259  predicted protein  61.48 
 
 
171 aa  161  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16843  predicted protein  66.02 
 
 
104 aa  143  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29021  predicted protein  65.35 
 
 
135 aa  140  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0364167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  40 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  38.89 
 
 
68 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  38.81 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>