23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0062 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0062  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.760214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2955  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3519  hypothetical protein  38.46 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2880  hypothetical protein  34.81 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0806  hypothetical protein  34.81 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2223  YopX protein  32.84 
 
 
224 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0645  YopX protein  32.84 
 
 
224 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0305  hypothetical protein  45.16 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0330  hypothetical protein  33.07 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.614067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0339  hypothetical protein  33.07 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.729949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1045  hypothetical protein  33.07 
 
 
245 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1064  hypothetical protein  33.07 
 
 
245 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4017  hypothetical protein  34.75 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0297  prophage Lp1 protein 30  34.69 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0749402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1434  hypothetical protein  36 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1571  hypothetical protein  33.68 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.351292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1105  phage protein  33.67 
 
 
131 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000280512  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2567  hypothetical protein  34.44 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415841  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0885  putative prophage Lp2 protein 26  36.08 
 
 
132 aa  42  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0262  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0465  hypothetical protein  32.68 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3842  hypothetical protein  34.78 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.262534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0269  hypothetical protein  31.88 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>