48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00220 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00220  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  163  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1592  MtN3 and saliva related transmembrane protein  43.04 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2007  MtN3 and saliva related transmembrane protein  34.62 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12051  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.822613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0587  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6970  hypothetical protein  35 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2290  hypothetical protein  46.67 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1370  hypothetical protein  37.18 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171684  hitchhiker  0.0000272645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4699  hypothetical protein  34.33 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06351  hypothetical protein  35.44 
 
 
94 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.472103 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0949  hypothetical protein  46.97 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.108318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0790  hypothetical protein  34.18 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0234458  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16431  hypothetical protein  35.8 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.66402 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1322  hypothetical protein  35.94 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14181  hypothetical protein  37.33 
 
 
115 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1257  hypothetical protein  36.49 
 
 
95 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2465  MtN3 and saliva related transmembrane protein  37.18 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1553  hypothetical protein  37.18 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0006877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2686  hypothetical protein  37.18 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0894462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3622  MtN3 and saliva related transmembrane protein  38.03 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0171455 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2883  hypothetical protein  35.82 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0517  hypothetical protein  40.32 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.771675  normal  0.68249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4557  hypothetical protein  29.27 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0644  hypothetical protein  35.82 
 
 
90 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0618893  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1244  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.454482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3357  MtN3 and saliva related transmembrane protein  44.87 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1419  Cystinosin/ERS1p repeat  39.06 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12511  hypothetical protein  35.44 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0192  hypothetical protein  32.05 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2031  hypothetical protein  30.99 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.301765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2305  MtN3 and saliva related transmembrane protein  36.36 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000162161  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0194  hypothetical protein  42.03 
 
 
78 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.887922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0862  hypothetical protein  34.85 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.615503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1476  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3696  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1274  hypothetical protein  41.38 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2119  hypothetical protein  32.79 
 
 
84 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000309813  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2356  hypothetical protein  34.43 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1930  hypothetical protein  38.33 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.787441  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1915  hypothetical protein  35 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13661  hypothetical protein  39.66 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0179157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3602  glutathione synthetase  34.85 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0101041 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13451  hypothetical protein  37.93 
 
 
88 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.159936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0151  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891641  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4623  hypothetical protein  38.6 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2565  hypothetical protein  30.67 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1255  hypothetical protein  36.92 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0118337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1876  MtN3 and saliva related transmembrane protein  28.79 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.200179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>