21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5322 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5322  putative lipoprotein  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697034  decreased coverage  0.000269029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4615  putative lipoprotein  68.13 
 
 		 97 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156329  normal  0.250438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0547  lipoprotein  44.21 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6293  hypothetical protein  40.96 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0654  lipoprotein  47.37 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  0.365168 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5997  hypothetical protein  39.76 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.259981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2961  hypothetical protein  40.74 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507112  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3086  hypothetical protein  40.74 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2269  hypothetical protein  40.74 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557007  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6371  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185091  normal  0.669684 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6783  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.031126  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5497  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2550  hypothetical protein  49.18 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0796987  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1520  pilus-associated lipoprotein  38.27 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7200  hypothetical protein  43.06 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0315017  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0590  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0794  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2359  hypothetical protein  38.96 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0646  hypothetical protein  35.9 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2645  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1494  hypothetical protein  42.22 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>