18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1049 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1049  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  1.46795e-13  normal  0.176851 
 
 
 
NC_008543  Bcen2424_4727  hypothetical protein  89.8 
 
 
245 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.00998e-10  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3640  hypothetical protein  89.8 
 
 
245 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.26312e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4584  hypothetical protein  88.98 
 
 
253 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.99252e-10  hitchhiker  7.64364e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5573  hypothetical protein  90.56 
 
 
245 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.75505e-11  hitchhiker  0.00177599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4119  hypothetical protein  87.76 
 
 
244 aa  406  1e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  7.21644e-09  hitchhiker  0.00853024 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3968  hypothetical protein  78.28 
 
 
241 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  3.95097e-12  normal  0.0223462 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1219  hypothetical protein  57.3 
 
 
282 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1291  hypothetical protein  57.3 
 
 
282 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132365  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0333  hypothetical protein  57.3 
 
 
282 aa  274  1e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0611  hypothetical protein  57.3 
 
 
282 aa  274  1e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0958  hypothetical protein  57.3 
 
 
282 aa  274  1e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2482  hypothetical protein  56.59 
 
 
273 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1348  hypothetical protein  56.59 
 
 
273 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1513  hypothetical protein  56.13 
 
 
270 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175272  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0412  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  23.17 
 
 
410 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0814  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  26.58 
 
 
399 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00207544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2929  3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme A reductase  27.38 
 
 
410 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>