34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3573 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3573  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0597766  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3947  hypothetical protein  98.98 
 
 
196 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180618  normal  0.604818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3488  hypothetical protein  92.35 
 
 
196 aa  291  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00401228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5109  hypothetical protein  92.35 
 
 
194 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5307  hypothetical protein  91.84 
 
 
196 aa  289  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2546  hypothetical protein  86.22 
 
 
177 aa  284  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5539  hypothetical protein  69.39 
 
 
194 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642633  normal  0.0183709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2133  hypothetical protein  69.9 
 
 
192 aa  237  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1751  hypothetical protein  72.96 
 
 
194 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2125  hypothetical protein  68 
 
 
200 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1321  hypothetical protein  67.51 
 
 
259 aa  227  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1544  hypothetical protein  63.78 
 
 
191 aa  199  2e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210916  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1456  hypothetical protein  63.78 
 
 
191 aa  199  2e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0044  hypothetical protein  63.27 
 
 
278 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5721  hypothetical protein  55.86 
 
 
325 aa  197  1e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277173  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0057  hypothetical protein  61.73 
 
 
184 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3678  hypothetical protein  55.9 
 
 
188 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3695  hypothetical protein  54.59 
 
 
212 aa  185  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.841303  normal  0.591313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0498  hypothetical protein  54.59 
 
 
212 aa  185  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3738  hypothetical protein  57.44 
 
 
199 aa  174  1e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1304  hypothetical protein  56.05 
 
 
241 aa  162  4e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1825  hypothetical protein  54.96 
 
 
210 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3014  hypothetical protein  55.8 
 
 
320 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1231  hypothetical protein  49.43 
 
 
199 aa  155  5e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0559905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003557  hypothetical protein  49.23 
 
 
210 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.57432e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02518  hypothetical protein  49.23 
 
 
210 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0989  hypothetical protein  48.21 
 
 
139 aa  135  3e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0344  hypothetical protein  51.61 
 
 
178 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3132  hypothetical protein  54.46 
 
 
271 aa  132  4e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3233  hypothetical protein  54.46 
 
 
271 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2053  hypothetical protein  39.59 
 
 
202 aa  130  8e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0738137  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3034  hypothetical protein  54.46 
 
 
200 aa  129  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2808  hypothetical protein  41.18 
 
 
186 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0150  hypothetical protein  43.36 
 
 
238 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>