46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5365 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5365  GP29  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5468  GP29  80 
 
 		 81 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3641  GP29  58.02 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0734  GP29  55.56 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  44.19 
 
 		 175 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  42.17 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  40.24 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  43.37 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  44.71 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  41.57 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  41.86 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  42.17 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  41.67 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  42.17 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  39.29 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  40.48 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  39.29 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  36.84 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  36.84 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  40.48 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  41.25 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  33.75 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  39.71 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  36.36 
 
 		 453 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  36.59 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  38.96 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  33.75 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>