25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1216 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1216  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1243  hypothetical protein  88.57 
 
 		 101 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6983  hypothetical protein  81.9 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  41.25 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  42.03 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  46.55 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  48.08 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  48.08 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  47.62 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  49.02 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  49.02 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  51.16 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  46.81 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  48 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  48 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  48 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  48 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  48 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  48 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  35.53 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  51.92 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>