10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0033 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_t0033  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1355  tRNA-Lys  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0077651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0061  tRNA-Lys  92.86 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0165866  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  90.91 
 
 
78 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  85.45 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0030  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  86 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0060  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260186  normal  0.112071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>