26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7106 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7106  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  100 
 
 		 414 aa  857    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0729  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  39.62 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1022 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  34.83 
 
 		 990 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  32.97 
 
 		 815 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  36.59 
 
 		 771 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  31.94 
 
 		 814 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  31.79 
 
 		 774 aa  179  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  32.07 
 
 		 779 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  33.25 
 
 		 795 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  31.79 
 
 		 779 aa  176  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  34.81 
 
 		 693 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  29.84 
 
 		 754 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  29.57 
 
 		 956 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.04 
 
 		 971 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.48 
 
 		 959 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.27 
 
 		 975 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.53 
 
 		 971 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.96 
 
 		 811 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  28.72 
 
 		 835 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  27.42 
 
 		 963 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  31.86 
 
 		 854 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  28.74 
 
 		 791 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 		 812 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  28.74 
 
 		 788 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.92 
 
 		 1240 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>