20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0069 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0069    100 
 
 		 105 bp  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  91.75 
 
 		 267 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  90.72 
 
 		 267 bp  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  89.69 
 
 		 267 bp  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  87.37 
 
 		 267 bp  93.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  87.37 
 
 		 267 bp  93.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    84.54 
 
 		 1092 bp  73.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0519    84.69 
 
 		 268 bp  67.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0515    90.2 
 
 		 225 bp  61.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291374  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2592    83.15 
 
 		 257 bp  58  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.743625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  81.44 
 
 		 267 bp  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1568    81.44 
 
 		 266 bp  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  81.05 
 
 		 267 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3392  hypothetical protein  84.75 
 
 		 207 bp  46.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  81.05 
 
 		 267 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  81.05 
 
 		 267 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  81.05 
 
 		 267 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3887    89.47 
 
 		 261 bp  44.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3868    89.47 
 
 		 261 bp  44.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  89.47 
 
 		 321 bp  44.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>