60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3403 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  81.42 
 
 		 114 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  65.49 
 
 		 113 aa  163  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  65.49 
 
 		 113 aa  163  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  71.17 
 
 		 113 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  64.55 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  62.28 
 
 		 114 aa  153  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  62.28 
 
 		 114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  61.11 
 
 		 214 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  61.26 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  59.82 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  75 
 
 		 111 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  73.91 
 
 		 111 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  72.83 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  72.83 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  72.83 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  56.14 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  72.83 
 
 		 111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  73.63 
 
 		 111 aa  136  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  58.77 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  54.21 
 
 		 169 aa  133  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  55.36 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  68.24 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  59.18 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  57.27 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  52.34 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  58.06 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  51.85 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  53.12 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  49.11 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  52.17 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  51.65 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  52.17 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  37.74 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  34.91 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  41.18 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  33.65 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  34.58 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  36.94 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  32.69 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  33.96 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  31.82 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  32.71 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  31.13 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  33.93 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  31.78 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  35.35 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  36.89 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  34.12 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  35.09 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  35.96 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  32.11 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  32.56 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  31.58 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>