15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0428 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0428  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000068891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0398  Integrase catalytic region  100 
 
 
400 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1433  Integrase catalytic region  100 
 
 
412 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0128  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000825928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0194  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0249438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1186  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
410 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1238  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00285925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1933  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0182276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1954  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1958  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0459  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0147669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0482  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1025  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
426 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1805  Integrase catalytic region  97.5 
 
 
433 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1456  Integrase catalytic region  95 
 
 
394 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>