11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0081 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0081  DinB  100 
 
 
164 aa  341  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3853  hypothetical protein  44.16 
 
 
165 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2312  DinB  39.62 
 
 
166 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7171  DinB family protein  37.2 
 
 
170 aa  107  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0681  hypothetical protein  37.42 
 
 
165 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340859  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0766  DinB family protein  37.5 
 
 
165 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4547  DinB  35.54 
 
 
172 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521013  normal  0.113984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1959  DinB family protein  35.48 
 
 
166 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.178951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4545  DinB  33.73 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.104149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  30.82 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2209  DinB family protein  27.95 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>