33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dd703_0229  CDS  NC_012880  259192  261747  +  2556  adenylate cyclase  YP_002985868  unclonable  0.0000702171  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0398  CDS  NC_012880  444935  445309  +  375  ribosomal protein S12  YP_002986033  unclonable  0.000000213628  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0547  CDS  NC_012880  609963  610661  -  699  Deoxyribonuclease I  YP_002986180  unclonable  0.000000480912  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0548  CDS  NC_012880  610762  611274  -  513  hypothetical protein  YP_002986181  unclonable  0.000000220186  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0549  CDS  NC_012880  611547  612701  -  1155  S-adenosylmethionine synthetase  YP_002986182  unclonable  0.00000243541  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0654  CDS  NC_012880  737658  738590  +  933  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_002986287  unclonable  0.00000112653  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0798  CDS  NC_012880  906301  906672  +  372  protein of unknown function DUF488  YP_002986431  unclonable  0.000000164638  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0799  CDS  NC_012880  906656  907375  -  720  Opacity-associated protein A  YP_002986432  unclonable  0.000000409608  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0849  CDS  NC_012880  968134  970374  +  2241  GDP/GTP pyrophosphokinase  YP_002986481  unclonable  0.0000221192  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1261  CDS  NC_012880  1439486  1442584  -  3099  beta-D-galactosidase  YP_002986885  unclonable  0.000337049  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1305  CDS  NC_012880  1493436  1494281  +  846  hypothetical protein  YP_002986929  unclonable  0.000000490747  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1491  CDS  NC_012880  1761729  1763882  -  2154  TonB-dependent siderophore receptor  YP_002987113  unclonable  0.000036194  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1588  CDS  NC_012880  1875847  1876083  +  237  acyl carrier protein  YP_002987209  unclonable  0.000000112562  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1662  CDS  NC_012880  1962681  1963664  +  984  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_002987281  unclonable  0.00000134968  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1663  CDS  NC_012880  1963797  1964033  -  237  LPP repeat-containing protein  YP_002987282  unclonable  0.000000205201  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1664  CDS  NC_012880  1964349  1965758  -  1410  pyruvate kinase  YP_002987283  unclonable  0.00000486614  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1702  CDS  NC_012880  2023873  2025042  +  1170  tetratricopeptide repeat protein  YP_002987321  unclonable  0.00000418527  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1719  CDS  NC_012880  2045431  2046984  +  1554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  YP_002987338  unclonable  0.00000712436  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2058  CDS  NC_012880  2437487  2438371  -  885  HtpX domain protein  YP_002987668  unclonable  0.000000452797  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2141  CDS  NC_012880  2527347  2528807  -  1461  hypothetical protein  YP_002987750  unclonable  0.0000028881  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2561  CDS  NC_012880  3006792  3007397  -  606  NUDIX hydrolase  YP_002988160  unclonable  0.000000630284  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2698  CDS  NC_012880  3153721  3154785  +  1065  outer membrane protein A  YP_002988297  unclonable  0.00000118487  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2730  CDS  NC_012880  3191649  3193046  +  1398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_002988329  unclonable  0.00000422836  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3018    NC_012880  3515948  3516022  +  75      unclonable  0.0000000611461  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3019  CDS  NC_012880  3516197  3516883  +  687  DNA mismatch repair protein  YP_002988615  unclonable  0.000000328639  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3188  CDS  NC_012880  3739944  3740900  -  957  cell division protein ZipA  YP_002988774  unclonable  0.00000114957  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3189  CDS  NC_012880  3741121  3741891  +  771  protein of unknown function DUF540  YP_002988775  unclonable  0.00000074726  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3352  CDS  NC_012880  3925606  3927570  -  1965  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_002988936  unclonable  0.00000888182  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3361  CDS  NC_012880  3934382  3935353  +  972  octaprenyl diphosphate synthase  YP_002988945  unclonable  0.000000777945  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3967  CDS  NC_012880  4597087  4599882  -  2796  DNA polymerase I  YP_002989542  unclonable  0.000137661  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3968  CDS  NC_012880  4600261  4600884  -  624  periplasmic protein disulfide isomerase I  YP_002989543  unclonable  0.000000322053  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_R0095  rRNA  NC_012880  4391637  4393167  -  1531  16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000583009  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_R0100  rRNA  NC_012880  4607158  4608688  -  1531  16S ribosomal RNA    unclonable  0.00000486614  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>