137 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Lreu_0008  CDS  NC_009513  9652  10215  +  564  single-strand binding protein  YP_001270621  unclonable  0.000000000000109058  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0031  CDS  NC_009513  33514  34377  +  864  sugar transport family protein  YP_001270644  unclonable  0.00000000000014774  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0053  CDS  NC_009513  66525  67874  +  1350  major facilitator transporter  YP_001270666  unclonable  0.0000000000090495  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0057    NC_009513  71540  72164  +  625      unclonable  0.000000000000104622  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0072  CDS  NC_009513  87721  88107  -  387  hypothetical protein  YP_001270684  unclonable  0.0000000000000259116  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0088  CDS  NC_009513  108608  109618  -  1011  LacI family transcription regulator  YP_001270700  unclonable  0.00000000000127052  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0136  CDS  NC_009513  162311  163606  +  1296  adenylosuccinate lyase  YP_001270745  unclonable  0.00000000000687142  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0137  CDS  NC_009513  163830  164549  +  720  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  YP_001270746  unclonable  0.000000000000360429  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0148  CDS  NC_009513  175934  177184  +  1251  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_001270757  unclonable  0.00000000000162194  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0149  CDS  NC_009513  182964  183152  +  189  hypothetical protein  YP_001270758  unclonable  0.00000000000000742029  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0150  CDS  NC_009513  183142  183498  +  357  IS66 Orf2 family protein  YP_001270759  unclonable  0.0000000000000176668  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0195  CDS  NC_009513  228242  229438  +  1197  major facilitator transporter  YP_001270802  unclonable  0.00000000000282756  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0196  CDS  NC_009513  229520  229813  -  294  FMN-binding domain-containing protein  YP_001270803  unclonable  0.0000000000000126758  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0197  CDS  NC_009513  229825  230466  -  642  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  YP_001270804  unclonable  0.000000000000114708  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0198  CDS  NC_009513  230764  232236  +  1473  amino acid permease-associated region  YP_001270805  unclonable  0.0000000000143228  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0257  CDS  NC_009513  292785  294161  +  1377  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  YP_001270864  unclonable  0.0000000000119311  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0277  CDS  NC_009513  321847  323346  +  1500  amino acid/peptide transporter  YP_001270884  unclonable  0.0000000000259644  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0278  CDS  NC_009513  323403  324233  +  831  metallophosphoesterase  YP_001270885  unclonable  0.000000000000290952  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0279  CDS  NC_009513  324592  325236  +  645  hypothetical protein  YP_001270886  unclonable  0.0000000000000764619  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0287  CDS  NC_009513  334708  335160  +  453  hypothetical protein  YP_001270894  unclonable  0.0000000000000334051  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0288  CDS  NC_009513  335463  337349  +  1887  glycoside hydrolase family protein  YP_001270895  unclonable  0.000000000148878  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0306  CDS  NC_009513  354455  354643  +  189  preprotein translocase subunit SecE  YP_001270913  unclonable  0.00000000000000907216  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0307  CDS  NC_009513  354762  355304  +  543  transcription antitermination protein nusG  YP_001270914  unclonable  0.0000000000000733893  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0308  CDS  NC_009513  355444  355869  +  426  50S ribosomal protein L11  YP_001270915  unclonable  0.0000000000000373457  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0309  CDS  NC_009513  355892  356653  +  762  50S ribosomal protein L1  YP_001270916  unclonable  0.000000000000338213  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0310  CDS  NC_009513  356831  358024  +  1194  GntR family transcriptional regulator  YP_001270917  unclonable  0.0000000000040274  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0356  CDS  NC_009513  404099  405709  +  1611  amino acid permease-associated region  YP_001270962  unclonable  0.0000000000370463  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0357  CDS  NC_009513  405794  407632  +  1839  amino acid permease-associated region  YP_001270963  unclonable  0.0000000000770343  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0385  CDS  NC_009513  437157  438518  +  1362  amino acid permease-associated region  YP_001270991  unclonable  0.00000000000859435  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0389  CDS  NC_009513  442357  442950  +  594  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  YP_001270995  unclonable  0.0000000000000773088  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0390  CDS  NC_009513  443355  444737  +  1383  amino acid permease-associated region  YP_001270996  unclonable  0.00000000000972649  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0391  CDS  NC_009513  444855  446405  +  1551  chloride channel, core  YP_001270997  unclonable  0.0000000000201773  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0418  CDS  NC_009513  472117  472977  +  861  sugar transport family protein  YP_001271024  unclonable  0.000000000000567912  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0433  CDS  NC_009513  485523  485852  +  330  hypothetical protein  YP_001271039  unclonable  0.0000000000000116721  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0491  CDS  NC_009513  544407  544814  -  408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001271096  unclonable  0.0000000000000392803  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0492  CDS  NC_009513  544839  545582  -  744  hypothetical protein  YP_001271097  unclonable  0.000000000000356658  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0499  CDS  NC_009513  552661  553995  +  1335  xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001271104  unclonable  0.00000000000767859  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0500  CDS  NC_009513  554127  554732  -  606  30S ribosomal protein S4  YP_001271105  unclonable  0.0000000000000917743  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0533  CDS  NC_009513  597088  599742  +  2655  alanyl-tRNA synthetase  YP_001271138  unclonable  0.0000000106893  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0637  CDS  NC_009513  705441  707285  +  1845  GTP-binding protein TypA  YP_001271239  unclonable  0.000000000155128  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0652  CDS  NC_009513  720978  722288  +  1311  trigger factor  YP_001271254  unclonable  0.0000000000093301  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0679  CDS  NC_009513  745049  745261  +  213  hypothetical protein  YP_001271281  unclonable  0.00000000000000935309  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0680  CDS  NC_009513  745305  745943  -  639  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001271282  unclonable  0.000000000000104622  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0681  CDS  NC_009513  746038  746793  +  756  O-methyltransferase-like protein  YP_001271283  unclonable  0.000000000000217038  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0682  CDS  NC_009513  746783  747073  +  291  excinuclease ABC subunit C  YP_001271284  unclonable  0.0000000000000227073  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0683  CDS  NC_009513  747075  748067  +  993  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_001271285  unclonable  0.00000000000118401  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0684  CDS  NC_009513  748230  749018  +  789  30S ribosomal protein S2  YP_001271286  unclonable  0.000000000000550841  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0688  CDS  NC_009513  751860  753032  +  1173  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_001271290  unclonable  0.00000000000168901  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0689  CDS  NC_009513  753491  753949  +  459  transposase IS200-family protein  YP_001271291  unclonable  0.0000000000000314281  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0690  CDS  NC_009513  754218  755030  +  813  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  YP_001271292  unclonable  0.000000000000341789  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0716  CDS  NC_009513  785096  786055  -  960  malate dehydrogenase (NAD)  YP_001271317  unclonable  0.00000000000101749  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0743  CDS  NC_009513  813548  814690  +  1143  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_001271344  unclonable  0.00000000000129687  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0763  CDS  NC_009513  835233  836483  +  1251  30S ribosomal protein S1  YP_001271364  unclonable  0.00000000000378884  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0779  CDS  NC_009513  850868  852988  +  2121  DNA topoisomerase I  YP_001271380  unclonable  0.000000000394767  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0780  CDS  NC_009513  853123  854001  +  879  aldose 1-epimerase  YP_001271381  unclonable  0.000000000000154006  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0781  CDS  NC_009513  854043  854672  -  630  membrane protein  YP_001271382  unclonable  0.0000000000000234105  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0782  CDS  NC_009513  854883  856907  +  2025  DNA topoisomerase IV subunit B  YP_001271383  unclonable  0.000000000186449  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0859  CDS  NC_009513  911057  912256  +  1200  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_001271459  unclonable  0.00000000000303579  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0860  CDS  NC_009513  912328  912495  -  168  hypothetical protein  YP_001271460  unclonable  0.00000000000000565608  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0861  CDS  NC_009513  912508  914037  -  1530  carbohydrate kinase, FGGY  YP_001271461  unclonable  0.0000000000108808  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0862  CDS  NC_009513  914265  914798  +  534  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001271462  unclonable  0.0000000000000272811  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0882  CDS  NC_009513  935436  936161  -  726  Ion transport 2 domain-containing protein  YP_001271482  unclonable  0.000000000000375333  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0910  CDS  NC_009513  964993  967182  +  2190  glycoside hydrolase, clan GH-D  YP_001271509  unclonable  0.000000000647683  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0960  CDS  NC_009513  1019181  1020572  +  1392  amino acid permease-associated region  YP_001271559  unclonable  0.0000000000121787  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0961  CDS  NC_009513  1020682  1021536  +  855  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_001271560  unclonable  0.000000000000233134  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1021  CDS  NC_009513  1072546  1074075  +  1530  transposase IS66  YP_001271618  unclonable  0.0000000000296334  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1024  CDS  NC_009513  1081481  1081768  -  288  hypothetical protein  YP_001271621  unclonable  0.0000000000000267141  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1025  CDS  NC_009513  1081877  1082713  -  837  phosphoglycerate mutase  YP_001271622  unclonable  0.000000000000345581  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1026  CDS  NC_009513  1082877  1083581  +  705  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  YP_001271623  unclonable  0.000000000000150801  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1065  CDS  NC_009513  1126723  1128225  -  1503  glycerol kinase  YP_001271659  unclonable  0.0000000000150653  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1067  CDS  NC_009513  1128628  1130457  -  1830  sodium/hydrogen exchanger  YP_001271661  unclonable  0.0000000000397977  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1072  CDS  NC_009513  1135931  1136494  -  564  peroxiredoxin  YP_001271666  unclonable  0.0000000000000624433  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1073  CDS  NC_009513  1136595  1137476  -  882  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  YP_001271667  unclonable  0.000000000000230696  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1074  CDS  NC_009513  1137488  1138150  -  663  L-serine ammonia-lyase  YP_001271668  unclonable  0.000000000000107918  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1075  CDS  NC_009513  1138222  1138449  -  228  hypothetical protein  YP_001271669  unclonable  0.00000000000000828721  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1076  CDS  NC_009513  1138449  1138913  -  465  hypothetical protein  YP_001271670  unclonable  0.000000000000033056  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1092  CDS  NC_009513  1156088  1156321  +  234  hypothetical protein  YP_001271686  unclonable  0.0000000000000351532  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1093  CDS  NC_009513  1156784  1157242  -  459  transposase IS200-family protein  YP_001271687  unclonable  0.0000000000000837902  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1094  CDS  NC_009513  1158479  1159678  -  1200  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_001271688  unclonable  0.00000000000219862  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1160  CDS  NC_009513  1213281  1213535  -  255  acyl carrier protein  YP_001271754  unclonable  0.0000000000000195346  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1161  CDS  NC_009513  1213572  1214603  -  1032  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_001271755  unclonable  0.00000000000204675  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1163  CDS  NC_009513  1216760  1218469  -  1710  Dak phosphatase  YP_001271757  unclonable  0.0000000000503094  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1164  CDS  NC_009513  1218495  1218857  -  363  hypothetical protein  YP_001271758  unclonable  0.0000000000000269961  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1165  CDS  NC_009513  1219052  1219237  -  186  50S ribosomal protein L28  YP_001271759  unclonable  0.0000000000000103471  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1166  CDS  NC_009513  1219387  1220037  -  651  thiamine pyrophosphokinase  YP_001271760  unclonable  0.000000000000150801  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1167  CDS  NC_009513  1220123  1220776  -  654  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  YP_001271761  unclonable  0.000000000000257786  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1176  CDS  NC_009513  1230617  1231237  -  621  guanylate kinase  YP_001271770  unclonable  0.0000000000000749098  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1212  CDS  NC_009513  1261242  1263857  +  2616  membrane protein-like protein  YP_001271806  unclonable  0.0000000118346  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1213  CDS  NC_009513  1263943  1264332  -  390  HesB/YadR/YfhF-family protein  YP_001271807  unclonable  0.0000000000000347858  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1214  CDS  NC_009513  1264482  1264958  -  477  transcription elongation factor GreA  YP_001271808  unclonable  0.0000000000000531032  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1215  CDS  NC_009513  1265022  1265678  -  657  uridine kinase  YP_001271809  unclonable  0.000000000000175656  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1216  CDS  NC_009513  1265791  1266429  -  639  NLP/P60 protein  YP_001271810  unclonable  0.000000000000177513  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1219  CDS  NC_009513  1270378  1270716  -  339  HxlR family transcriptional regulator  YP_001271813  unclonable  0.0000000000000243781  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1230  CDS  NC_009513  1279836  1280393  -  558  hypothetical protein  YP_001271824  unclonable  0.0000000000000525482  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1240  CDS  NC_009513  1286574  1286771  -  198  50S ribosomal protein L35  YP_001271834  unclonable  0.00000000000000491229  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1241  CDS  NC_009513  1286794  1287306  -  513  translation initiation factor 3  YP_001271835  unclonable  0.0000000000000256408  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1250  CDS  NC_009513  1296152  1297456  -  1305  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_001271844  unclonable  0.00000000000708446  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1270  CDS  NC_009513  1319830  1321518  -  1689  arginyl-tRNA synthetase  YP_001271864  unclonable  0.0000000000463651  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1286  CDS  NC_009513  1332295  1333311  -  1017  LacI family transcription regulator  YP_001271880  unclonable  0.0000000000013505  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_1354  CDS  NC_009513  1410843  1411970  -  1128  hypothetical protein  YP_001271941  unclonable  0.00000000000360215  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>