33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Aazo_0001    NC_014248  96  1758  +  1663      unclonable  0.00000515989  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0002  CDS  NC_014248  2007  2231  +  225  hypothetical protein  YP_003719792  unclonable  0.000000514823  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0003  CDS  NC_014248  2814  2942  +  129  hypothetical protein  YP_003719793  unclonable  0.000000520094  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0004  CDS  NC_014248  3380  4228  +  849  hypothetical protein  YP_003719794  unclonable  0.00000224703  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0860  CDS  NC_014248  915579  916433  -  855  glutamate racemase  YP_003720398  unclonable  0.00000213664  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0861  CDS  NC_014248  916581  918476  -  1896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_003720399  unclonable  0.0000195536  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1044  CDS  NC_014248  1114720  1114959  +  240  hypothetical protein  YP_003720529  unclonable  0.000000274038  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1045  CDS  NC_014248  1115515  1116576  +  1062  group 1 glycosyl transferase  YP_003720530  unclonable  0.00000151909  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1480  CDS  NC_014248  1550512  1551495  +  984  RpoD subfamily RNA polymerase sigma 70 subunit  YP_003720816  unclonable  0.00000452918  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2050    NC_014248  2129746  2132094  -  2349      unclonable  0.000015841  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2051    NC_014248  2130069  2131613  +  1545      unclonable  0.00000393528  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3060  CDS  NC_014248  3151480  3152925  -  1446  glutamyl-tRNA synthetase  YP_003721949  unclonable  0.00000448328  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3775  CDS  NC_014248  3832699  3833247  -  549  hypothetical protein  YP_003722434  unclonable  0.000000635481  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3776  CDS  NC_014248  3833603  3834280  -  678  ABC transporter-like protein protein  YP_003722435  unclonable  0.00000114768  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3777  CDS  NC_014248  3834294  3834566  -  273  hypothetical protein  YP_003722436  unclonable  0.000000616585  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3778  CDS  NC_014248  3834890  3835945  +  1056  photosystem II D2 protein  YP_003722437  unclonable  0.0000016634  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3779  CDS  NC_014248  3836904  3838589  +  1686  carbohydrate-selective porin OprB  YP_003722438  unclonable  0.00000785609  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3846  CDS  NC_014248  3898161  3898409  +  249  hypothetical protein  YP_003722484  unclonable  0.00000112454  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3847    NC_014248  3898516  3898830  +  315      unclonable  0.00000141613  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3848  CDS  NC_014248  3899728  3900603  +  876  diacylglycerol kinase catalytic region  YP_003722485  unclonable  0.0000041794  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3903  CDS  NC_014248  3956570  3957448  +  879  hypothetical protein  YP_003722530  unclonable  0.00000280049  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4421  CDS  NC_014248  4501661  4502476  -  816  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_003722852  unclonable  0.00000164624  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4422  CDS  NC_014248  4502566  4503159  -  594  hypothetical protein  YP_003722853  unclonable  0.00000112454  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4505  CDS  NC_014248  4597789  4598007  -  219  hypothetical protein  YP_003722906  unclonable  0.000000808004  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4610  CDS  NC_014248  4715834  4718200  +  2367  peptidase M23  YP_003722973  unclonable  0.0000163265  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4838  CDS  NC_014248  4949253  4950527  -  1275  S-adenosylmethionine synthetase  YP_003723114  unclonable  0.00000220213  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4839  CDS  NC_014248  4950720  4951721  -  1002  Phosphoribulokinase  YP_003723115  unclonable  0.00000156566  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4962  CDS  NC_014248  5081591  5082463  -  873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003723213  unclonable  0.00000187582  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4978  CDS  NC_014248  5098972  5099466  +  495  photosystem I reaction center protein PsaF subunit III  YP_003723225  unclonable  0.00000164624  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0040  tRNA  NC_014248  3153047  3153120  -  74  tRNA-Asp    unclonable  0.000000389023  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0045  tRNA  NC_014248  3832449  3832520  -  72  tRNA-Asn    unclonable  0.00000031214  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0046  tRNA  NC_014248  3898971  3899056  +  86  tRNA-Tyr    unclonable  0.000000858289  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0047  tRNA  NC_014248  3899145  3899216  +  72  tRNA-Thr    unclonable  0.000000841137  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>